1. Lãnh đạo Trung tâm: Giám đốc và 02 Phó Giám đốc
1.1. Giám đốc là người đứng đầu Trung tâm, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở Nông nghiệp và Môi trường, trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Trung tâm.
1.2. 02 Phó Giám đốc là người giúp Giám đốc chỉ đạo một số nhiệm vụ công tác, chịu trách nhiệm trước Giám đốc, trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công.
2. Các phòng, chuyên môn, nghiệp vụ và Trại:
2.1. Phòng Hành chính – Tổng hợp (bao gồm: Tổ chức, hành chính, kế toán)
2.2. Phòng Chuyển giao khoa học kỹ thuật
2.3. Phòng Kế hoạch – Đào tạo và Thông tin, tuyên truyền
2.4. Trại thực nghiệm giống thủy sản, giống cây ăn quả và cây lâm nghiệp.
Đơn vị có: 39 cán bộ, viên chức trong đó: Trình độ trên Đại học 8 người; trình độ  kỹ sư, cao đẳng 31 người;